Gestionnaire de grands jeux de données en écologie du plancton F/H
Location
Villefranche sur Mer, Alpes Maritimes | France
Job description
Poste
(réf.SCSI20)
CDD de 12 mois renouvelable
Fonctions : Gestionnaire de grands jeux de données en écologie du plancton F/H
Emploi - type : Ingénieur biologiste en traitement de données - A2A41
Catégorie : A
Corps : IGE
BAP : A
Mission :
La mission de ce data manager sera de faciliter la gestion des grands jeux de données d’imagerie générés par l’équipe (plusieurs millions d’enregistrements) ; cela impliquera la requête des données, leur contrôle qualité, et leur visualisation dynamique.
Activités principales :
- Écrire et mettre en œuvre des outils de requête dans les bases de données de l’équipe et les bases internationales pour assembler des jeux de données complets pour la recherche.
- Écrire et mettre en œuvre des filtres de contrôle qualité sur les données extraites ; documenter ce contrôle qualité et en conserver la trace durant toute la vie de la donnée.
- Écrire et publier des applications de visualisation et d’exploration dynamique des données extraites, pour les rendre accessible en temps réel.
- Opérationnaliser et maintenir le calcul de produits dérivés des données brutes (produits gridés, interpolés, etc.)
Autres activités :
Soutien des personnels de l’équipe (notamment étudiants) à l’écriture de code impliquant de grands jeux de données. Écriture et mise à disposition de petits codes interne permettant d’automatiser des processus et de résoudre des problèmes.
Encadrement : Non
Conditions particulières d'exercice :
- Contrat de 12 mois, renouvelable. Salaire entre 2276 et 3560€ brut mensuels selon expérience et formation. Congés jusqu’à 55 jours par an.
- Le laboratoire est situé à Villefranche sur mer et propose un accès direct à la rade de Villefranche.
Profil
Connaissances transversales requises :
- Nature et formats de données en écologie, notamment marine (.csv mais aussi netCDF, éventuellement .parquet)
- Connaissances générales en écologie, si possible en océanographie biologique, voire en planctonologie.
- Statistique et traitement de données (transformations usuelles, détection d’outliers, analyses multivariée simples)
- Visualisation de données (graphiques usuels -boxplot, violin plot, etc.- mais aussi cartographie et graphiques dynamiques, impliquant du javascript)
- Éventuellement : traitement d’images (segmentation, mesure)
- Éventuellement : apprentissage supervisé pour la classification d’images
- Langue anglaise : B1 à B2
Savoir-faire :
- Maitrise avérée de la programmation dans un langage de traitement de données (R ou/et Python)
- Connaissance fine des libraires pour le traitement et la visualisation de données (tidyverse en R ; numpy, pandas, matplotlib, etc. en Python)
- Expérience avec un outil de visualisation/d’exploration dynamique de données (shiny en R ; Dash en Python)
- Éventuellement : familiarité avec les outils de computer vision et/ou de machine learning associés (scikit-image, TensorFlow, Pytorch).
Savoir-être :
- Attrait le travail en équipe, afin répondre aux besoins/sollicitations de nombreuses personnes
- Bonne capacité d’organisation et d’autonomie
- Goût pour l’écriture de code informatique.
Job tags
Salary
2 276 € a 3 560 €
